南京农业大学动物医院是集医疗、教学、科研于一体的综合性动物医院，是南京农业大学对外开展社会服务的动物医院，也是南京农业大学动物医学专业教学实习基地，承担本科生和硕士生的临床实习课程教学任务。医院在小动物（犬、猫）的诊疗方面具有丰富的临床经验，在业界具有较高的信誉和声望。
医院建筑面积2600平方米，分为教学科研部和动物医学服务部。动物医学服务部分门诊部、住院部、检验中心、手术中心、影像诊断中心、宠物用品超市等部门。年门诊量约2万余病例，住院病例约2000余例。医院设施先进、兽医技术力量雄厚，深受客户信赖，在国内同行中享有较高声誉，已成为周边主要疑难病例转诊医院。
医院拥有专业技术人员27名，其中特聘专家教授3人、专职兽医师5人、轮诊值班教授/副教授9人、住院医生3人、助理医生7人，硕士及以上人员20人，本科学历7名。医院作为动物医学专业学生的重要实践实习部门，每年接受约150名本科生,约70名研究生和留学生的临床实习，接待数十名外院进修医师学习。
